Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms