Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1P21675 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1P21675 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TAF1P21675 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms