Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCB4P21439 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms