Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RALAP11233 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RALAP11233 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RALAP11233 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RALAP11233 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RALAP11233 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RALAP11233 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RALAP11233 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RALAP11233 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RALAP11233 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RALAP11233 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RALAP11233 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RALAP11233 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RALAP11233 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RALAP11233 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RALAP11233 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RALAP11233 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RALAP11233 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RALAP11233 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RALAP11233 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RALAP11233 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms