Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms