Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SRRM5B3KS81 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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