Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RCOR3Q9P2K3 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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