Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms