Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIM5Q9C035 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIM5Q9C035 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIM5Q9C035 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIM5Q9C035 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TRIM5Q9C035 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TRIM5Q9C035 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TRIM5Q9C035 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TRIM5Q9C035 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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