Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOL6Q9BWW8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms