Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAMP1Q96JM3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms