Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDAC11Q96DB2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms