Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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