Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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SCG3Q8WXD2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SCG3Q8WXD2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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