Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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