Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMF1P82094 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms