Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms