Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms