Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK8P49336 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK8P49336 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK8P49336 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK8P49336 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK8P49336 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms