Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP5P45974 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP5P45974 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP5P45974 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms