Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GGCXP38435 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms