Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPB2P35606 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms