Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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HOXA13P31271 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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HOXA13P31271 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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HOXA13P31271 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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HOXA13P31271 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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