Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms