Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PRKCHP24723 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PRKCHP24723 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PRKCHP24723 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PRKCHP24723 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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PRKCHP24723 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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PRKCHP24723 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PRKCHP24723 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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