Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTMAP06454 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTMAP06454 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTMAP06454 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTMAP06454 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTMAP06454 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTMAP06454 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTMAP06454 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTMAP06454 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTMAP06454 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTMAP06454 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTMAP06454 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms