Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV12-3P01733 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms