Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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