Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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