Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms