Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms