Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms