Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SEMA4CQ9C0C4 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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