Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 282 ms