Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BSXQ3C1V8 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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