Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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