Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms