Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms