Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms