Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SH3BGRP55822 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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