Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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