Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms