Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRCC3P46736 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms