Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BMI1P35226 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BMI1P35226 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms