Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA6P23229 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms