Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms