Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCP2P22307 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms