Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1P21675 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1P21675 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1P21675 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms