Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms