Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF2P15336 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATF2P15336 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATF2P15336 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms